對“未批先建”的違法行為，2014年修訂的新《環(huán)境保護法》第61條和第63條增加了處罰條款，該條款與2002年發(fā)布實施的老《環(huán)境影響評價法》第31條相比，沒有規(guī)定“責令限期補辦手續(xù)”的內(nèi)容。

新《環(huán)境影響評價法》第31條，亦刪除了原《環(huán)境影響評價法》第31條關于“限期補辦手續(xù)”的規(guī)定，不再將“限期補辦手續(xù)”作為行政處罰的前置條件，但并未禁止建設單位主動補交環(huán)境影響報告書、報告表報送審批。

因此，建設單位只要有“未批先建”的違法行為，環(huán)保部門應當首先對“未批先建”違法行為作出處罰，限期補辦不再是對“未批先建”行為免于處罰的條件，更不能作為不予處罰的借口，也不再是環(huán)保部門對“未批先建”違法行為進行處罰的前置條件，即一旦發(fā)現(xiàn)有“未批先建”的情形，立即做出處罰。

當然，如果建設單位及時改正“未批先建”的違法行為，主動積極來生態(tài)環(huán)境主管部門補辦環(huán)評手續(xù)，并且，其“未批先建”行為并未造成生態(tài)環(huán)境危害后果，屬于“首違不罰”的情形，應該根據(jù)《行政處罰法》第33條的規(guī)定，可以不予處罰。

但是，生態(tài)環(huán)境主管部門仍要注意兩個方面的問題，一是要監(jiān)督建設單位及時整改違法行為，并不是不予處罰就等于不監(jiān)管了，執(zhí)法不能以罰代改，也不能“首違不罰”就不管了，監(jiān)督建設單位及時整改才是執(zhí)法的目的。

因此，存在“未批先建”違法行為的建設單位，如果及時改正其違法行為，主動報批該建設項目的環(huán)境影響報告書或者環(huán)境影響報告表的，生態(tài)環(huán)境主管部門應當予以受理。

生態(tài)環(huán)境主管部門應當通過受理和審查“未批先建”建設項目環(huán)評手續(xù)，將所有建設項目依法納入環(huán)境管理，為實現(xiàn)排污許可證“核發(fā)一個行業(yè)，清理一個行業(yè)，規(guī)范一個行業(yè)”提供保障。

二是要監(jiān)督建設單位補辦的環(huán)評手續(xù)是否規(guī)范，補辦還應當遵守國家有關環(huán)評的標準、導則和技術規(guī)范等。

例如，生態(tài)環(huán)境部公布的南京紅太陽生物化學公司環(huán)評文件弄虛作假案，就是在補辦環(huán)評手續(xù)時造假。

2021年7月2日，南京市生態(tài)環(huán)境局執(zhí)法人員對南京紅太陽生物化學有限責任公司（以下簡稱紅太陽公司）現(xiàn)場檢查時發(fā)現(xiàn)，該公司及時改正了“未批先建”的違法行為，補辦了《80噸/天廢水生化處理項目及500平方米危廢倉庫項目環(huán)境影響報告表》。

但是，紅太陽公司未如實反映其污水處理站廢氣治理設施的實際建設內(nèi)容，其環(huán)評報告表中引用的監(jiān)測數(shù)據(jù)與原始監(jiān)測報告中的數(shù)據(jù)不一致。

經(jīng)查，紅太陽公司的廢水生化污水處理站和廢氣治理設施，都是實際于2019年5月建成投用。2021年4月，該公司以4000元價格委托南京睿華勘察設計有限公司為其編制《80噸/天廢水生化處理項目及500平方米危廢倉庫項目環(huán)境影響報告表》（補辦環(huán)評手續(xù)），并于2021年5月26日取得環(huán)評批復。

2020年8月至2021年1月期間，紅太陽公司陸續(xù)將其綜合治理車間的8個百草枯工藝廢水儲罐的含有氨和非甲烷總烴的尾氣，接入污水處理站的廢氣處理裝置內(nèi)處理，但是在補辦環(huán)評手續(xù)編制的環(huán)評文件中未能如實反映工藝改造過程，仍按照原有工藝編寫 。

同時，環(huán)評文件編制過程中，該建設單位委托南京某環(huán)境科技集團股份有限公司進行現(xiàn)狀監(jiān)測，原始監(jiān)測報告顯示廢氣處理裝置出口非甲烷總烴第一次監(jiān)測結果和均值監(jiān)測結果分別為39.1毫克/立方米和13.5毫克/立方米，而環(huán)評編制單位出具的環(huán)評文件引用的監(jiān)測數(shù)據(jù)與原始監(jiān)測結果不一致。

南京市生態(tài)環(huán)境局根據(jù)《環(huán)境影響評價法》第32條的規(guī)定，對紅太陽公司處以50萬元罰款，并責令改正違法行為；對其法定代表人趙某某和項目主要負責人陳某某各處5.2萬元罰款。

對環(huán)評文件編制單位南京睿華勘察設計有限公司處以1.2萬元罰款，并責令改正違法行為。同時，根據(jù)失信記分辦法對環(huán)評編制單位予以失信記分，環(huán)境影響評價信用平臺已注銷編制主持人段某某的誠信檔案。

還需要注意的是，如果建設單位存在違反環(huán)境保護設施“三同時”竣工驗收制度，或者超過污染物排放標準排污等違法行為的，應當依照《建設項目環(huán)境保護管理條例》和《大氣污染防治法》《水污染防治法》等法律法規(guī)分別予以處罰。